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NEWSXPJ基因调控新宠:深入解析环状RNA的奥秘
来源:邹梵毓 日期:2025-03-08circRNAs(环形RNA分子)是生物体内存在的一类特殊非编码RNA,其特征是没有5‘末端帽子和3’末端poly(A)尾巴,并以共价键形成环状结构。1976年,Sanger等首次在高等植物中发现了致病性的单链环状病毒,这标志着人类对circRNA的首次认识。尽管circRNA已被发现数十年,长期以来被视为错误剪接的产物,但在2013年其科研价值被重新认识,迅速成为基因调控领域的明星分子。
在2013年,Nature杂志同步发表了两篇关于circRNA的研究,揭示其能够阻断miR-7,从而推动了相关研究的快速发展。在真核细胞中,circRNA通过特定的可变剪切机制生成,其中大部分来源于外显子,少部分内含子来源的circRNA则存在于细胞核中。这些分子的表达水平受种属、组织及时间的特异性影响,同时具备一定的序列保守性。与线性RNA相比,circRNA因为其闭合环状结构而具有更高的稳定性,使其不易被核酸外切酶降解。
绝大多数circRNA为非编码类型,主要在转录或转录后水平上调控基因表达,虽然也有少量circRNA能够翻译成多肽。特别地,circRNA能够充当microRNA的“海绵”,通过与其结合来调整microRNA对靶mRNA的抑制效果。这种被称为“microRNA海绵效应”的机制,可以通过吸附microRNA以降低其活性,间接增加下游基因的表达。例如,环状RNA Cdr1as 能够与miR-7结合,调控神经元中神经递质谷氨酸的释放,进而影响神经功能。研究显示,Cdr1as可以结合超过70个miR-7结合位点,有效调节其活性,因此在神经系统中扮演重要角色。
此外,circRNA还能与RNA结合蛋白(RBP)相互作用,调节其活性。某些circRNA甚至可以作为增强子或支架,促进不同蛋白之间的相互作用,影响信号转导与基因表达。例如,circ-Foxo3与细胞周期调控蛋白结合,从而抑制细胞周期进展,实现对细胞增殖的负调控。另一个例子是circZKSCAN1,通过与RBP相互作用抑制肝癌细胞的迁移和侵袭,显示出在癌症发生和发展中具有关键作用。
近日,《分子细胞》发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心的研究,解析了在生理条件下circRNA被内切酶DIS3监控降解的新机制,为圈出circRNA的生理特征及调控提供了新见解。
为提升circRNA的研究效率,采用高通量测序技术如RNA-seq及Nanopore测序,可以高效鉴定其全长序列与可变剪接事件,并进行量化分析。此外,使用微阵列技术能够快速检测circRNA的表达谱。通过实时定量PCR(qPCR)设计特异性引物并针对逆向剪接位点进行分析,也为不同样本间的circRNA表达水平的比较提供了便利。
随着高通量测序技术的普及,XPJ借助深厚的技术基础和创新能力,已成为研究环状RNA的主流解决方案供应商,提供从样本类型到建库全程的完整解决方案。
尽管circRNA的研究已取得显著进展,但其在疾病中的具体作用机制仍需深入探讨。未来的研究方向将包括探索它的生成机制和调控网络,揭示不同疾病中circRNA的作用机理,开发基于其的疾病诊断和治疗策略,以及探索其在生物技术和合成生物学中的应用潜力。通过这些研究,将进一步澄清circRNA的生物学意义以及在疾病诊断和治疗中的重要作用。
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